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如果您的苹果手机在删除短信后仍然显示红点，这可能是由于通知中心仍然提示有未读短信导致的。您可以尝试以下方法来解决这个问题。
1、清除所有通知：打开您的手机设置，找到“通知”选项，然后点击“信息”或“短信”，将“标记”开关关闭，并手动清除所有短信通知，这样应该可以清除红点。
2、重启设备：有时候重启设备可以解决一些软件问题，包括这个问题，您可以尝试关机并重新启动手机。
3、检查是否有未读短信：虽然您可能已经删除了短信，但可能仍有未读的短信留在您的短信应用中，您可以尝试打开短信应用并检查是否有任何未读消息，如果有，请查看并标记为已读，这应该会消除红点。
4、更新软件：确保您的iOS系统是最新的版本，更新系统可以解决一些已知的问题。
如果以上方法都不能解决问题，建议您联系苹果官方客服寻求帮助，他们可能会提供更具体的解决方案或建议您进行进一步的故障排除。